kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Genome Biology contigのscaffolding metagenome 2021 8/23 インストール手順と実行手順を追記 メタゲノムデータからゲノムセグメントを再構築することは非常に複雑な作業である。リピートやシーケンスエラーなどの一般的な課題に加えて、メタゲノムアセンブリでは、コミュニティ内の生物間のカバレッジの深さの不均一性や、ほぼ同一の株間の差異を許容する必要がある。これまでの手法では、ゲノム上のバリアントを平滑化することでこれらの問題に対処してきた。ここでは、MetaCarvelと呼ばれるバリアントを考慮したメタゲノム・スキャフォールドを発表する。このスキャフォールドは、リピート検出の新しい戦略とバリアント発見のためのグラフ解析を組み合わせたものである… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F04%2F29%2F131122" title="メタゲノムコンティグのscaffoldingを行う MetaCarvel - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210824/20210824211913.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-04-29 13:11:22 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/04/29/131122 1.0 100%