kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ Binning (metagenomics) Nanopore long read Pacbio 2020 Bioinformatics メタゲノム研究は、さまざまな環境下で見られる微生物群集の構成と構造に関する重要な知見を提供している。メタゲノムデータを解析するための技術のうち、ビニングは、存在するさまざまな微生物の種を特徴づけるための重要なステップと考えられている。しかし、多くのビニングツールでは、ショートリードデータを使用しているため、種特異的なシグナルが十分に得られないなどの限界があり、ロングリードシーケンス技術の登場により、その限界を克服する機会が訪れている。しかし、現在のメタゲノム解析用ビニングツールのほとんどは、ショートリード用に開発されたものである。ロングリードを処理できる数少ないツールは、入力サイズの増加に対応… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F06%2F20%2F234630" title="(メタゲノム) ロングリードのビニングツール MetaBCC-LR - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210620/20210620233225.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-06-20 23:46:30 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/06/20/234630 1.0 100%