kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 Bioinformatics virome metadata Binning (metagenomics) deep neural network メタゲノム解析は、微生物群集の特徴を明らかにし、マイクロバイオームと生物学的プロセスの複雑な関連性を解明する可能性を秘めている。アセンブリは、メタゲノミクス実験において最も重要なステップの1つである。アセンブリとは、重複するDNAシーケンスリードを、微生物群集のゲノムを十分に正確に表現できるように変換することである。このプロセスは計算上困難であり、多くのコンティグに渡ってゲノムが断片化されてしまうのが一般的になっている。計算機上のビニング法は、コンティグをその配列組成、存在量、染色体の構成に基づいて、コミュニティのゲノムを表すビンに分割することで、断片化を緩和するために使用される。既存のビン化… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F07%2F19%2F201905" title="ウィルスメタゲノムのビニングのための効率的な深層学習ツール CoCoNet - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2021-07-19 20:19:05 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/07/19/201905 1.0 100%