kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ k-mer 2021 Preprint 高速なツール variant human genome web tool primer CRISPR 2022 Nucleic Acids Research 2022/05/21 論文引用 K-merは、ゲノム配列解析に使用される短いDNA配列である。K-merを使ったアプリケーションには、ゲノムアセンブリやアラインメントがある。しかし、バイオインフォマティクスの分野でk-merを広く利用するには、ゲノム配列データの巨大化に伴う課題がある。ヒトゲノムのアセンブリには、何十億もの短い配列が含まれている。k-mer情報を効果的に利用するための計算量は膨大であり、特に複数のゲノムアセンブリを扱う場合にはその量は膨大なものとなる。これらの問題を解決するために、著書らは、k-merキーを検索するために調整されたハッシュテーブルをベースにした、新しいk-mer… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F08%2F20%2F073000" title="（ヒトゲノム）超高速なk-mer問い合わせwebサービス KmerKeys - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20210814/20210814210233.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-08-20 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/08/20/073000 1.0 100%