kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ pseudogene 2021 Preprint binder bacteria bacterial annotation 結果の視覚化 (visualization) 2022 Molecular Biology and Evolution 2022/07/09 論文引用 原核生物のゲノムは一般的に遺伝子密度が高く、偽遺伝子（機能していない、あるいは不活性化された遺伝子の残骸）は比較的少ない。しかし、近年の生態系の変化や、共生生物や病原体が経験したような極端な個体数の減少など、特定の状況下では、偽遺伝子が急速に蓄積され、ゲノムのかなりの部分を占めるようになることがある。したがって、偽遺伝子を同定することは、原核生物のゲノムに作用する進化の力や、ゲノムにコード化された機能的可能性を理解するための重要なステップである。ここでは、偽遺伝子の同定と解析に特化したオープンソースソフトウェア「Pseudofinder」を紹介する。Pseudo… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2021%2F10%2F19%2F073000" title="原核生物ゲノム中の偽遺伝子候補を検出する Pseudofinder - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20211018/20211018233224.png Hatena Blog https://hatena.blog 2021-10-19 07:30:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2021/10/19/073000 1.0 100%