kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ API GO enrichment analysis GMT format tips mouse Enrichrは哺乳類の遺伝子セットエンリッチメント解析ツールで、転写制御、パスウェイ、GOやヒトの表現型のオントロジー、薬剤で処理した細胞からのシグネチャーなどが収録されている（wiki）。GSEApyはEnrichrのPythonラッパーで、コマンドラインやPython上でDEGsを調査することができる。 Documentation https://gseapy.readthedocs.io/en/latest/introduction.html A Protocol to Prepare files for GSEApy https://gseapy.readthedocs.io/en/… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F01%2F09%2F193738" title="GSEApy - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220109/20220109125341.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-01-09 19:37:38 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/01/09/193738 1.0 100%