kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Molecules and Cells GO enrichment analysis KEGG web tool cancer human genome 遺伝子発現表現型の遺伝子セット解析には、 over-representationアプローチとaggregate scoreアプローチという2つの主要なアプローチがある（Irizarry et al.、2009）。 over-representationアプローチでは、発現データセットから差分発現遺伝子（DEG）群を選択し、選択したDEGの中で各注釈付き遺伝子セットの過剰発現の有意性を超幾何検定などの統計検定により計算する。この方法は合理的であるが、いくつかの欠点がある。例えば、この方法では、有意性の低い遺伝子は発現表現型において重要でない遺伝子として扱われる。したがって、結果はDEGsを選択す… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F01%2F11%2F000000" title="ネットワークに基づく遺伝子セットエンリッチメント解析を行う NGSEA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220110/20220110231606.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-01-11 00:00:00 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/01/11/000000 1.0 100%