kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ G3: Genes, Genomes, Genetics 2021 HMM orthologue protein search 2026/02/19 追記 ゲノムデータから目的の遺伝子を同定し、検索することは、多くのバイオインフォマティクスアプリケーションにとって不可欠なステップである。本発表では、プロテオームデータから、クエリプロファイルの隠れマルコフモデル配列アライメントと高い配列類似性を持つ遺伝子を自動的に同定し検索するコマンドラインツール、orthofisherを紹介する。orthofisherは、遺伝子アノテーションの品質評価、系統解析のための単一コピーオーソログ遺伝子の同定、遺伝子コピー数の推定、ゲノムデータからの相同遺伝子の同定と検索に依存する他の進化解析に有用であると考えられる。orthofisherは… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F01%2F19%2F021025" title="遺伝子同定と検索を自動化するための広範に適用可能なツール orthofisher - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220119/20220119012827.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-01-19 02:10:25 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/01/19/021025 1.0 100%