kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ RNA seq database SRA plant GEO IGV co-expression 結果の視覚化 (visualization) ハイスループットRNA-sequencing（RNA-seq）は、その低コストと高いカバレッジにより、ここ10年で最も人気のある遺伝子発現プロファイリング技術になった。その結果、植物界からのRNA-seqライブラリの数は近年飛躍的に増加している。トウモロコシ、イネ、ダイズ、小麦、綿花などの主要作物について、2021年までに合計～45,000のライブラリを収集した。RNA-seqライブラリのビッグデータを最大限に活用するためには、統一された処理パイプラインによってすべての公開ライブラリを統合し、使いやすい検索可能なデータベースにキュレーションする取り組みが緊急に必要とされている。この課題に取り組… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F01%2F31%2F000540" title="植物の公共RNA-Seqライブラリを分析するためのユーザーフレンドリ―なデータベース PPRD - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220130/20220130230652.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-01-31 00:05:40 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/01/31/000540 1.0 100%