kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 Genome Biology diploid assembly Nanopore long read Pacbio ハプロタイプを考慮した2倍体ゲノムアセンブリは、ゲノミクス、精密医療、その他多くの分野で極めて重要である。ロングリードシーケンス技術により、ゲノムアセンブリは大幅に改善された。しかし、現在のロングリードアセンブラは、リファレンスベースのためバイアスがかかっていたり、2倍体ゲノムのハプロタイプの多様性を捉えることができなかったりする。本著者らは、ロングリードから二倍体ゲノムのハプロタイプを再構成するde novoアプローチであるphasebookを発表する。phasebookは、ハプロタイプカバレッジにおいて他のアプローチを大きく上回り、さらにアセンブリエラーとアセンブリの連続性の点でも競争力の… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F02%2F27%2F235919" title="ハプロタイプを考慮したロングリードからの2倍体ゲノムアセンブリを行う phasebook - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220227/20220227235342.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-02-27 23:59:19 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/02/27/235919 1.0 100%