kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2022 Nucleic Acids Research rRNA RNA seq filtering metatranscriptome metagenome GPU deep neural network 2022/03/11追記 2023/03/05 追記 トランスクリプトームやトランスラトーム技術の進歩により、RNAの活性プロファイルやRNAによる制御機構を深く研究することが可能になった。リボソームRNA（rRNA）配列は細胞内RNAの中で非常に豊富に存在するが、ターゲット配列にポリアデニレーションが含まれていない場合、ライブラリ調製時にこれらを容易に除去することができず、下流の解析を加速・改善するためには計算技術によるポストホックの除去が必要となる。本発表では、BiLSTM（Bi-directional Long Short-Term Memory）ニューラルネットワークをベースに、トラン… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F03%2F09%2F233539" title="メタゲノム、メタトランススクリプトーム、ncRNAのシークエンシングデータからrRNA配列を正確かつ高速に検出・除去する RiboDetector - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220310/20220310001802.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-03-09 23:35:39 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/03/09/233539 1.0 100%