kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2022 Ecology and Evolution amplicon sequence consensus caller Nanopore long read reference free オックスフォード・ナノポア・テクノロジーズ（ONT）は、携帯可能で低コストなシーケンスの可能性から、生態学研究において人気を集めている第3世代のシーケンサー技術である。この技術はロングリードのシーケンスを得意とするが、アンプリコンのシーケンスにも応用できる。ONTの欠点は、生のリードの品質が低いことである。したがって、高品質のコンセンサス配列を生成することは、依然として課題である。本著者らは、ONTでシーケンスされたアンプリコンを、配列と長さの類似性に基づいて参照なしで選別し、確かなコンセンサス配列を構築するためのツール、Amplicon_sorterを紹介する。 GIthubより このスクリ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F03%2F17%2F223852" title="ロングリードアンプリコンのソートとコンセンサス配列の構築のためのツール amplicon_sorter - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220317/20220317215531.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-03-17 22:38:52 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/03/17/223852 1.0 100%