kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 PeerJ reciprocal best hit BLAST シーケンシングデータを解析するためのバイオインフォマティクスソリューションは数多く存在するが、系統樹の作成を最終目的とした全ゲノムシーケンス（WGS）データからの標的配列検索のためのオプションはほとんど存在しない。利用可能なツールは、特に深い系統レベルで苦労しており、アミノ酸空間検索を必要とするため、偽陽性結果の割合が増加する可能性がある。また、多くのツールはインストールが難しく、十分なユーザーリソースがない可能性がある。ここでは、自由に利用できる相同性検索ツールを用いて、アセンブルされたWGSデータから相同性検索を行うプログラムについて説明する。ゲノムアノテーションが存在する2つの分岐した昆… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F03%2F20%2F013524" title="アライメントに基づく配列抽出ソフトウェア ALiBaSeq - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220320/20220320012900.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-03-20 01:35:24 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/03/20/013524 1.0 100%