kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 連鎖地図 assembly 2022 BMC Bioinformatics De novoゲノムアセンブリでは、通常、完全なゲノムではなく、コンティグのセットが作成される。そのため、ゲノムの完全な構造を決定するためには、遺伝的連鎖地図、オプティカルマップ、Hi-Cデータなどの追加データが必要となる。従来の研究では、コンティグを整列・配置するために、このようなデータを利用していた。 本論文では、追加データを用いたゲノムアセンブリのためのフレームワークを紹介する。本アプローチは、リードをクラスタリングし、各クラスタ内のリードが追加データに従ってゲノムの近傍の位置に由来するようにすることに基づく。これらのリードはそれぞれ独立にアセンブルされ、得られたコンティグがさらに階層的… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F05%2F11%2F123114" title="階層的ガイドゲノムアセンブラ HGGA - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2022-05-11 12:31:14 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/05/11/123114 1.0 100%