kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2022 Bioinformatics contamination target assembly filtering bacteria DNAシーケンシングの技術進歩に伴い、バクテリアゲノムのショートリードによる全ゲノムアセンブリ（WGA）は、ごく一般的な作業となっている。ゲノムのアセンブリプロセスには絶対的な黄金律がなく、多くの異なるツールを組み合わせて一連のステップを実行する必要がある。しかし、最終的なアセンブリの品質は、常に入力データの品質と強く関連している。このことを念頭に置いて、本著者らはWGA-LPを開発した。このパッケージは、微生物解析のための最先端のプログラムと、サンプルとアセンブリ結果の両方の品質をチェックし改善するための新しいスクリプトを接続するものである。WGA-LPは、保守的な汚染除去アプローチにより、… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F06%2F09%2F235348" title="（スモールゲノム）汚染されたシークエンシングデータをフィルタリングしながらアセンブリする半自動化されたパイプライン WGA-LP - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220610/20220610004822.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-06-09 23:53:48 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/06/09/235348 1.0 100%