kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2022 Preprint SARS-CoV-2 phylogenetic tree viewer 2022/06/11 誤字修正 COVID-19の大流行により、シークエンスデータの規模が一変し、SARS-CoV-2のゲノムは地球上のどの生物よりも多く配列決定された。これまでの系統樹探索のためのウェブベースのツールは、この規模の樹に直接スケールアップすることができなかった。本著者らは、WebGLを使用して、数千万ノードの系統樹を探索できる新しいツール、Taxoniumを開発した。Taxoniumは、突然変異を注釈した系統樹を可視化し、各内部ノードの遺伝子型を表示し、各ノードを関連するメタデータにリンクすることができる。オプションのサーバーサイドバックエンドにより、広く利用されているデータセ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F06%2F13%2F011414" title="大規模な系統樹を探索するためのウェブベースのツール Taxonium - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220613/20220613000958.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-06-13 01:14:14 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/06/13/011414 1.0 100%