kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 高速なツール 2022 Preprint polish human whole genome population genomics k-mer ロングリードシーケンス技術の進歩により、ゲノムアセンブリの連続性と完全性が劇的に改善された。最新のナノポアシーケンサーを用いれば、フローセル1個からヒトゲノムのアセンブリに必要なデータを生成することができる。これらのシーケンスから得られるロングリードデータを用いて、ゲノムの半分以上がメガベーススケールのコンティグに含まれるde novoゲノムアセンブリを日常的に作成することができるようになった。しかし、ナノポアデータのみで作成されたアセンブリは、比較的エラー率が高く、より正確なリードを使用してコンセンサス配列のエラーを修正する、ポリッシングと呼ばれるプロセスが有効である。この原稿では、JASP… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F06%2F25%2F013456" title="集団特異的なリファレンスゲノムを作成するための高速なゲノム研磨ツール JASPER - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220625/20220625115211.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-06-25 01:34:56 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/06/25/013456 1.0 100%