kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2019 Nature Communications de novo transcriptome assembly RNA-seqリードからの転写産物アセンブルは、遺伝子発現やその後の機能解析において重要なステップとなる。本発表では、複数のRNA-seqサンプルを同時に解析するアプローチに基づく、正確かつ効率的なトランスクリプトアセンブラであるPsiCLASSを紹介する。PsiCLASSは、複数サンプルにまたがるエキソン特徴抽出のための混合統計モデルと、スプライスグラフに基づく動的プログラミングアルゴリズム、および転写産物選択のための重み付け投票スキームを組み合わせて構成されている。PsiCLASSは感度-精度のトレードオフを大幅に改善し、現在最も優れた2つのアプローチであるStringTieシステムおよび… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F08%2F26%2F094416" title="複数サンプルを使った効率的な転写産物アセンブラ PsiCLASS - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2022-08-26 09:44:16 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/08/26/094416 1.0 100%