kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2014 Gene web tool bacteria archaea taxonomic assignment 2015 Microbial Ecology メタゲノム解析はここ数年、目覚しい発展を遂げた。今日、遺伝子配列決定の専門家だけでなく、他の専門分野の多くの研究室が、臨床サンプルや環境サンプルから得られたDNA配列を解析する必要がある。メタゲノム解析データの系統解析は、生物学者やバイオインフォマティシャンにとって重要な課題となっている。AMPHORAプログラムとそのワークフロー版は、メタゲノム・データに対して信頼性の高い系統解析結果をもたらす、一般に公開されているソフトウェアの一例である。 このウェブサーバーはAMPHORA2ワークフローに基づいており、入力されたメタゲノム試料で見つかった各系統マーカー遺伝子に対して、確率的に重み付けされた… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F09%2F25%2F164131" title="系統マーカー遺伝子に分類群を割り当てる AmphoraNetと結果を視覚化するAmphoraVizu - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20220925/20220925163303.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-09-25 16:41:31 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/09/25/164131 1.0 100%