kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ web tool docker 結果の視覚化 (visualization) sashimi plot differential alternative splicing (DAS) splicing variant RNA seq Hi-C クロマチンの発現、タンパク質-DNA/RNA相互作用、アクセス性、構造などが条件や細胞種によってどのように異なるかを同時に可視化することにより、オルタナティブスプライシングの制御機構や機能的影響について理解を深めることができる。しかし、既存のSashimiプロット作成ツールは、柔軟性に欠け、複雑で、複数のバイオインフォマティクスフォーマットや様々なゲノミクスアッセイからのデータソースを統合するには使い勝手が悪いままである。そのため、より拡張性のある可視化ツールが必要とされている。ここでは、プログラマブルでインタラクティブなWebベースのアプローチにより、出版品質の可視化を生成するPythonパ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2022%2F11%2F21%2F120406" title="スプライシングバリエーションを視覚化する sashimi.py - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20221121/20221121122231.png Hatena Blog https://hatena.blog 2022-11-21 12:04:06 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2022/11/21/120406 1.0 100%