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  <author_name>kazumaxneo</author_name>
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  <blog_title>macでインフォマティクス</blog_title>
  <blog_url>https://kazumaxneo.hatenablog.com/</blog_url>
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    <anon>NAR Genomics and Bioinformatics</anon>
    <anon>2020</anon>
    <anon>ab initio gene prediction</anon>
    <anon>protein-to-genome alignment</anon>
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  <description>著者らは、真核生物ゲノムにおける遺伝子予測のための高速かつ高精度なアルゴリズムの作成に向けて、いくつかのステップを踏んできた。まず、ab initio gene findingを効率的に行うための自動化手法、GeneMark-ESを導入し、教師無しでパラメータを繰り返し学習させた。次に、GeneMark-ETでは、教師なし学習とShort RNA Readsのマッピングによって明らかになったイントロン位置の情報を統合する方法を提案した。GeneMark-EPは、タンパク質データベースという、シーケンシングプロジェクト開始前に入手可能な別の外部情報源を利用するツールである。GeneMark-EP…</description>
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  <published>2022-12-31 13:13:29</published>
  <title>ProtHint</title>
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