kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ BMC Bioinformatics 2004 ab initio gene prediction 計算機による遺伝子予測は、特に実験データの少ないゲノムに対して重要な問題であり続けている。様々なゲノムに容易に適応できるように設計されたSNAP遺伝子検出器を紹介する。また、SNAP遺伝子検出器のパラメータは、系統的に最も近いゲノムのパラメータとは限らないことを示した。また、ブートストラップパラメータ推定では、外来遺伝子探索がより有効であり、その結果得られるパラメータは非常に正確であることがわかった。 遺伝子予測は種特異的なパラメータに敏感であるため、すべてのゲノムに専用のgene finderが必要である。 HP https://korflab.github.io/ Documentatio… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F01%2F02%2F012424" title="Ab initio遺伝子予測器 SNAP - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230101/20230101233319.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-01-02 01:24:24 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/01/02/012424 1.0 100%