kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2022 Frontiers in Genetics Nanopore long read Pacbio テスト失敗 PacBioやOxford Nanoporeのような1分子シーケンスの急速な発展に伴い、出力されるリードの長さは増加し続けており、最先端のゲノムアプリケーションに劇的な可能性を与えている。これらのリードをリファレンスゲノムにマッピングすることは、ダウンストリーム解析のための最も基本的で計算負荷の高いステップとなる。しかし、これらの長いリードは、ショートリードに比べてシーケンスエラーが多く、構造変異（SV）のブレイクポイントをまたぐ可能性が高いため、多くの未アラインリードや部分アラインリードが発生することが知られている。その結果、これらの手法はエンド・ツー・エンドのアライメントを得るよりも、クエ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F02%2F14%2F102052" title="ノイズの多いロングリードの高感度で高速なマッピングを行う kngMap - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2023-02-14 10:20:52 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/02/14/102052 1.0 100%