kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 BMC Bioinformatics Viruses variant SARS-CoV-2 web tool docker automated pipeline COVID-19のパンデミックでも示されたように、日々増加する複数のウイルス株のシーケンスデータから効率的にバリアントをコールできることは、世界中に広がるウイルス株を追跡するために最も重要なことである。 SARS-CoV-2のようなウイルス集団の解析に必要な複数の作業を支援する、インストールが簡単で使いやすいアプリケーション、MALVIRUSを紹介する。(1) 集団配列から変異（SNP/indel）カタログを作成し、(2) 読み取ったサンプルに対応するカタログの変異を効率的にジェノタイピングし、アノテーションを行うことができる。イルミナとナノポアのサンプルを用いたテストにより、SARS-CoV… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F02%2F14%2F121501" title="ウイルスバリアント解析のための統合アプリケーション MALVIRUS - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230214/20230214105355.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-02-14 12:15:01 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/02/14/121501 1.0 100%