kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ synteny_block karyogram web tool 結果の視覚化 (visualization) circos HPより 単純な生物でさえ膨大な数の遺伝的特徴を持つため、シンテニックプロットでは膨大な数の接続が乱立し、構造を理解することが困難となる。AccuSynは、ゲノムビューとブロックビューの2つのビューでシンテニック関係を可視化することにより、高いレベルの対話性と性能を提供する。ゲノムビューでは、環状プロットを用いてゲノムの全体像を把握し、染色体間で類似した遺伝子ブロックをすべて探索することができる。ブロックビューでは、各ブロックの遺伝子位置のペアを、染色体ごとに別々のスケールを用いて表示する。また、最適化問題の最適解に近い解を得るためのヒューリスティック手法として知られるシミュレーテッド・アニー… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F02%2F15%2F100040" title="染色体間で類似した遺伝子ブロックを可視化する AccuSyn - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230215/20230215002139.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-02-15 10:00:40 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/02/15/100040 1.0 100%