kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ assembly graph phasing 結果の視覚化 (visualization) genome browser レポジトリより近年の科学の進歩により、利用可能なゲノム配列情報は膨大な量に達している。以前は、この配列情報は単一の参照配列から構成されており、比較的容易に線形に可視化することができた。今日、私たちはしばしば、特定のDNA配列の複数のvariantsを知っている。これらは、同じ種の異なる個体の配列である場合もあれば、異なる種の相同な（＝祖先を共有する）配列である場合もある。個々の配列の違いは多型と呼ばれ、その大きさは、1塩基対の変異からDNAの長いストレッチを含む変異まで様々である。配列間の差異を解析し、表現型の違いに関連付けることで、解析した配列の機能に関する結論が得られる。グラフデータ構造は… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F02%2F16%2F234403" title="vgのゲノム配列グラフを可視化するためのJavaScriptモジュール Sequence Tube Maps - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230216/20230216232330.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-02-16 23:44:03 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/02/16/234403 1.0 100%