kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2023 Bioinformatics KBase metagenome virus bacterial annotation metabolic reconstruction 微生物ゲノムのアノテーションとは、DNA配列中の構造的・機能的エレメントを特定し、そのエレメントに生物学的情報を付加するプロセスである。DRAMは、純粋培養やメタゲノムから得られた細菌、古細菌、ウイルスのゲノムをアノテーションするために開発されたツールである。DRAMは、従来のアノテーションツールを超えて、複数の遺伝子アノテーションを機能的可能性のあるゲノムレベルに要約している。このような利点がある一方で、DRAMの欠点は、大規模な計算機資源を必要とするため、その利用が制限されることである。さらに、ゲノムアノテーションを必要とする下流の代謝モデリングツールとの統合もできなかった。このような制約… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F05%2F04%2F123415" title="DRAMをKBaseサイバーインフラストラクチャーに統合した kb_DRAM - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230504/20230504114540.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-05-04 12:34:15 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/05/04/123415 1.0 100%