kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2023 Bioinformatics nextflow Viruses Nanopore long read ナノポアシークエンシングによるウイルスゲノムの検出と解析は、病原体アウトブレイクのサーベイランスにおいて大きな可能性を示している。しかし、ナノポアシーケンスをサポートするウイルス検出パイプラインの数は非常に限られている。この論文では、NanoporeまたはIlluminaシーケンス入力からウイルスゲノムを検出するための新しいパイプラインであるVirPipeを紹介する。VirPipeのソースコードとドキュメントは、https://github.com/KijinKims/VirPipe から自由にダウンロードできる。PythonとNextflowで実装されている。 wiki https://gi… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F07%2F11%2F034059" title="ナノポアのロングリードからウイルスゲノムを検出する VirPipe - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230711/20230711111908.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-07-11 03:40:59 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/07/11/034059 1.0 100%