kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2023 Preprint metagenome Pacbio polish GFA dereplication Nature Biotechnology 2024 2023/08/03 全面的に修正 2024/01/03 論文引用、タイトル修正 2025･08･13 コマンド修正 高精度ロングリードのための新しいメタゲノミクスアセンブラを紹介する。metaMDBGとして実装された本アプローチは、minimizer空間における高効率なde Bruijnグラフアセンブリと、ゲノムカバレッジ深度のばらつきに対応するためのmulti-k'アプローチ、および株の複雑さを単純化するための存在量ベースのフィルタリング戦略の両方を組み合わせたものである。その結果、最新のアルゴリズムよりも効率的でありながら、より優れたアセンブリ結果が得られた。MetaMDBGは、競合アセ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F07%2F23%2F225740" title="minimizer空間でメタゲノムのアセンブリを行う metaMDBG - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230723/20230723234611.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-07-23 22:57:40 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/07/23/225740 1.0 100%