kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ Nature Biotechnology 2023 snakemake phylogenetic tree Inference automated pipeline 2023/08/05 間違った説明を修正 系統樹は、生命のツリーを横断して進化の歴史を整理するための枠組みを提供し、メタゲノム同定などの下流の比較解析に役立つ。16S rRNAのような単一マーカー遺伝子に依存する手法では、数十万種の生物で精度の低い系統樹が作成される一方、ゲノムワイドなデータを使用する手法では、大量のゲノムに対して拡張性がない。著者らは、分割統治戦略（dividide-and-conquer strategy）を用いて、ゲノムワイドな推論を更新可能にする手法であるupdating trees using divide-and-conquer (uDance)を紹介する。この手法… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F08%2F04%2F094131" title="正確で拡張可能な系統樹を構築する uDance - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20230804/20230804093814.png Hatena Blog https://hatena.blog 2023-08-04 09:41:31 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/08/04/094131 1.0 100%