kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ oriC fasta/fastqの操作 circular レポジトリより（一部改変） Dnaaplerはシンプルなpythonプログラムで、一塩基の入力配列（FASTA形式）を受け取り、アミノ酸配列データベースに対してblastxを用いて目的の開始遺伝子を見つけ、この遺伝子の開始コドンが見つかったかどうかをチェックし、見つかった場合は、この遺伝子を順鎖に持つように染色体をreorientation（以後、再配向）する。元々Unicyclerの再配向機能をdnaAで再現するために設計されたが、プラスミドやファージ、あるいはdnaapler custom、dnaapler mystery、dnaapler nearestで任意の入力FASTAで動作するよ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2023%2F08%2F12%2F145757" title="完全な環状ゲノムの開始位置（+1）を素早く変更する Dnaapler - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2023-08-12 14:57:57 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2023/08/12/145757 1.0 100%