kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2023 Preprint metagenome テスト失敗 メタゲノム解析には、リードベースの分類学的プロファイリング、アセンブル、メタゲノムアセンブリゲノム（MAGs）のビニングが一般的である。ここでは、これらのステップを統合したRead Annotation Tool (RAT)を報告する。RATを使ってMAGやコンティグから得られる強固な分類学的シグナルを用いて、リードアノテーションを強化することに成功した。RATは高い精度と感度で分類学的プロファイルを再構築し、他の最先端ツールを凌駕している。多様性の高い地下水サンプルでは、RATはメタゲノミックリードの大部分をアノテーションし、適切な、時には高い分類学的ランクで新規分類群を呼び出すことができた… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F01%2F04%2F130542" title="分類学的シグナルを組み込むことでメタゲノムリードのアノテーションと分類学的プロファイリングを改善する RAT - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2024-01-04 13:05:42 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/01/04/130542 1.0 100%