kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint repetitive sequences large genome 真核生物ゲノムの大部分を占める反復配列の正確なアノテーションは、様々なゲノム解析に不可欠である。データベースフリーのde novoリピート検出アプローチは、十分にキュレートされたリピートデータベースがないゲノムのアノテーションに威力を発揮する。しかし、既存のツールでは十分なリピート検出性能が得られていない。 本研究では、seed-and-extension法に基づくde novoインタースパースリピート検出ソフトウェアプログラムであるREPriseを開発した。REPriseのアルゴリズムは、現在デファクトスタンダードであるRepeatScoutのアルゴリズムと類似しているが、本著者らはREPr… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F01%2F31%2F033325" title="De novoで散在性反復配列を検出する REPrise - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20240131/20240131035132.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-01-31 03:33:25 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/01/31/033325 1.0 100%