kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 高速なツール 2024 Preprint phylogenetic tree Inference 2016年以降、NCBIでリファレンスゲノムが利用可能な微生物種の数は3倍以上に増えている。Multiple genome alignmentは、共通の祖先を共有する複数のゲノムのヌクレオチドを特定するプロセスであり、多くの下流の比較解析手法の入力として使用される。Parsnpは、現在のゲノムデータ時代に対応できる数少ないマルチプルゲノムアライメント手法の1つであるが、2014年の最初のリリース以来、メジャーリリースは行われていない。このギャップを解決するために、本著者らはParsnp v2を開発した。Parsnp v2では、ユーザーがプログラムの実行をよりコントロールできるようになり、Par… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F02%2F03%2F024411" title="大規模微生物データセットのためのスケーラブルなコアゲノムアライメント Parsnp 2.0 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2024-02-03 02:44:11 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/02/03/024411 1.0 100%