kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ Bioinformatics Advances 2024 高速なツール k-mer fasta/fastqの操作 MerCat2（"Mer-Catenate2"）は、オミックスデータ中のフィーチャーをロバストに解析するための、汎用性、並列性、拡張性、モジュール性を備えたソフトウェアパッケージである。MerCat2は、あらゆるプラットフォームからのHTSシークエンシングの生リード、アセンブルされたコンティグ、タンパク質配列を入力として、任意の長さkのk-merカウントを実行し、フィーチャーアバンダンスカウント表、品質管理レポート、タンパク質フィーチャーメトリクス、グラフ表示（主成分分析（PCA）など）を生成する。MerCat2は、他のプロファイラーやアセンブリベースの手法では実行できない、全てのデータを初期… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F05%2F23%2F025507" title="大規模なデータセットにもスケールする多目的k-merカウンターおよび多様性推定器 MerCat2 - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20240523/20240523161831.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-05-23 02:55:07 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/05/23/025507 1.0 100%