kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint protein search BLAST metagenome ゲノムおよびメタゲノムの比較は、サンプル間で異なる、または共通する遺伝的エレメントを同定することに依存している。これらの遺伝的エレメントは、シークエンシングリードをアセンブルし、アセンブリ中の遺伝的エレメントを同定することによって、またはリード中のヌクレオチド配列をリファレンスの遺伝的エレメントのヌクレオチド配列に整列させることによって同定できる。前者は目的の遺伝的エレメントの完全なアセンブリに依存し、後者はヌクレオチドで表されたリファレンス配列に依存する。メタゲノムデータでは、遺伝子を含む遺伝的エレメントが断片化されていることが多く、その結果、遺伝的エレメント中やその周辺でコンティグが切断さ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F06%2F06%2F001952" title="生のメタゲノムシークエンシングリードからターゲットのタンパク質を読んだリードを同定する Lapidary - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20240606/20240606001100.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-06-06 00:19:52 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/06/06/001952 1.0 100%