kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 bacteria Preprint 結果の視覚化 (visualization) ゲノム比較 (comparative genomics) plasmid phage gene cluster 高速なツール NAR Genomics and Bioinformatics 比較ゲノム解析では、ゲノムの遺伝子座のアラインメントを可視化することがよくある。PythonやRのライブラリからスタンドアローンのGUIまで、このタスクのためにいくつかのソフトウェアツールが利用可能であるが、高速で自動化された使用法と出版可能なベクター画像の作成を提供するツールが不足している。 ここでは、LoVis4uを紹介する。LoVis4uは、複数のゲノム遺伝子座を高度にカスタマイズ可能かつ高速に可視化するために設計されたコマンドラインツールとPython APIである。LoVis4uは、GenBankまたはGFFファイルからのアノテーションデータに基づいて、PDF形式のベクター画像を生成… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F10%2F10%2F162506" title=" 比較ゲノミクスのための遺伝子座の可視化ツール LoVis4u - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20241010/20241010160034.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-10-10 16:25:06 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/10/10/162506 1.0 100%