kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ Preprint 2021 large genome phasing assembly graph hybrid assembly ロングリードやHi-Cは、難易度の高いゲノムに対して連続性の高いアセンブリを可能にし、ゲノムアセンブリの分野に革命をもたらした。現在では、あらゆる種類の生物でハプロイドの染色体レベルのアセンブリが一般的に達成されているため、アセンブリフェージングはゲノム再構成の新たなフロンティアとなっている。ロングリードやHi-Cを用いてアセンブリをフェージングするツールは既にいくつかリリースされているが、いずれも直線的な配列からスタートするため、ヘテロ接合度の高い非モデル生物には適していない。GraphUnzipは、ロングリードやHi-Cデータを用いてアセンブリグラフを構成するハプロタイプにアンジップする、… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F10%2F26%2F222032" title="ヘテロ接合度の高い非モデル生物のアセンブリグラフをハプロタイプにアンジップする GraphUnzip - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20241026/20241026231131.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-10-26 22:20:32 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/10/26/222032 1.0 100%