kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint mapping Pacbio Nanopore long read 逆位、重複、その他の医学的に重要な変異は、日常的な遺伝子解析では無視されがちである。リピートの性質と複雑さにより、最新の配列アラインメント手法では正確にアラインメントすることが困難である。本著者らは、この限界が、 linear edits（欠失、挿入、置換）のみによって相同配列を整列させようとする、現在の配列整列手法の基本的なアプローチに起因することを示す。ここでは、VACmapという革新的なマッピング手法を紹介する。VACmapは、 linear editsとnon-linear editsの両方を統合し、リードを分割したり直線的なサブアラインメントを組み立てたりすることなく、複雑なリアレン… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F11%2F03%2F182333" title="複雑な構造変異を発見するために特別に設計されたロングリードアライナー VACmap - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> Hatena Blog https://hatena.blog 2024-11-03 18:23:33 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/11/03/182333 1.0 100%