kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint orthologue HMM 正確なオルソロジー推定は、比較ゲノム学や系統学にとって不可欠である。しかし、オルソロジーの推定は、古くから分岐している生物の間で顕著な配列の分岐によって困難が伴う。OrthoHMMは、置換行列をパラメータとする隠れマルコフモデルを用いてオルソログ遺伝子群を推論するアルゴリズムであり、リモートホモログの検出を可能にする。ベンチマークによると、OrthoHMMは現在利用可能な方法を凌駕している。例えば、Bilaterian orthogroupsのキュレーションセットを使用した場合、OrthoHMMは10.3 - 138.9%の精度向上を示した。Bilaterianオルソグループと、3つの主要な真… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F12%2F20%2F084227" title="隠れマルコフモデルを用いてオルソログ推論を改善する OrthoHMM - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20241220/20241220114612.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-12-20 08:42:27 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/12/20/084227 1.0 100%