kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ repetitive sequences https://www.biostars.org/p/483594/より bbmask.shはSTR（リピート長1-15bp）をマスクすることができ、findrepeats.shは様々なタイプの長いリピートや部分的なリピートを見つけて報告またはマスクすることができる。 インストール いくつかのツールはcondaでダウンロードできるBBtoolsパッケージには含まれない。ソースコードをダウンロードして使用した。 cd bbmap/chmod u+x ./*sh >./findrepeats.sh Written by Brian Bushnell Last modified July 5, 20… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2024%2F12%2F25%2F211241" title="ゲノムのリピート配列を素早く検出するBBtoolsのfindrepeats.sh - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20241225/20241225202913.png Hatena Blog https://hatena.blog 2024-12-25 21:12:41 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2024/12/25/211241 1.0 100%