kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint pan-proteome structural aligners NAR Genomics and Bioinformatics 高速なツール phylogenetic marker genes structural core genes GPU 2026/02/01 追記 あるクレードのほとんどのメンバーに共通するシングルコピーのコア遺伝子の解析は、系統復元やゲノムの質の評価など、生物学における重要な課題にとって重要である。コア遺伝子は従来、プロテオーム間のアミノ酸類似性の解析によって同定されてきたが、構造を用いて定義することもできる。AIによるタンパク質構造予測の精度は飛躍的に向上したが、プロテオミクス規模での完全な3次元構造モデルの取得には、まだ法外な時間がかかっている。ここでは、structural core genesを下流の系統解析に適したスケールで同定するための新しい手法であるUnicoreを紹介する。入力プロテオームにP… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2025%2F01%2F29%2F013320" title="コア遺伝子の立体構造情報を使って正確な系統復元を行う Unicore - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20250128/20250128222103.png Hatena Blog https://hatena.blog 2025-01-29 01:33:20 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2025/01/29/013320 1.0 100%