kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2025 Preprint nextflow contamination fasta/fastqの操作 docker 2025/02/14 追記 多くの生物学的および医学的な疑問は、配列データの解析に基づいて解答されている。しかし、様々なリードコレクションやアセンブリにおいて、コンタミネーション、人工的なスパイクイン、過剰発現したrRNA配列が見つかることがある。特に、イルミナやナノポアのデータで知られているようなコントロールとして使用されるスパイクインは、しばしばコンタミネーションとして考慮されず、また解析中に適切に除去されない。さらに、ヒト宿主DNAの除去は、個人を特定できないようにするためのデータ保護や倫理的配慮のために必要な場合がある。 本著者らは、ロングリードとショートリードの両方のシーケンス技術か… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2025%2F02%2F10%2F073610" title="シーケンシングデータの汚染を除去するnextflowパイプライン CLEAN - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20250210/20250210075601.png Hatena Blog https://hatena.blog 2025-02-10 07:36:10 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2025/02/10/073610 1.0 100%