kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2021 Plant Methods plant phylogenetic marker genes dispensable genes taxonomically restricted genes (TRGs) pan-genome 系統（種、属、高次のクレード）における遺伝子の非消耗性は、多くのゲノムシーケンスプロジェクトがパンゲノームレベルに移行するにつれて重要性を増している。ほとんどの解析では、遺伝子を、調査対象となったすべてのゲノムに存在する「コア遺伝子」と、調査対象となった一部のゲノムにしか存在しない「ディスパーサブル（使い捨て）遺伝子」に分類している。コア遺伝子とディスパーサブル遺伝子の分類は、解析対象ゲノムにおける存在/非存在の任意のカットオフ値に基づいていることが多い。QUODでは、遺伝子をコアまたはディスペンサブルに分類する代わりに、各遺伝子にディスペンサブルスコアを付与する。QUODは、様々な環境条件に… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2025%2F02%2F15%2F060944" title="ディスペンサブル遺伝子（dispensable genes）を評価する QUOD - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20250215/20250215074619.png Hatena Blog https://hatena.blog 2025-02-15 06:09:44 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2025/02/15/060944 1.0 100%