kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2024 Preprint Ancient DNA assembly 古代メタゲノムデータセットのde novoアセンブリは困難な作業である。シークエンシングされた古代DNA分子は、超短断片サイズと特徴的な死後損傷パターンにより、現在のツールでは理想的なアセンブリを行うことができない。CarpeDeamは、古代メタゲノムサンプルに特化して設計された、損傷を考慮した新しいde novoアセンブラである。サンプル固有の損傷パターンを統合する最尤フレームワークを利用することで、CarpeDeamは既存のアセンブラと比較して、シミュレーションデータセットと経験的データセットの両方から、より連続性の高い配列とより多くのタンパク質配列を復元する。古代メタゲノム解析のパイオニ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2025%2F03%2F28%2F015619" title="損傷の激しい古代データセットのためのデノボメタゲノムアセンブラ CarpeDeam - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20250328/20250328130802.png Hatena Blog https://hatena.blog 2025-03-28 01:56:19 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2025/03/28/015619 1.0 100%