kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2025 Nature Communications Binning (metagenomics) Pacbio Nanopore long read ロングリードシーケンスはメタゲノミクスを変革し、メタゲノムアセンブルゲノム（MAG）の品質を向上させた。しかし、現在のビニング手法では、未知の種の同定や不均衡な種分布の管理が課題となっている。本稿では、天然マイクロバイオーム中のMAGを再構築するために特別に設計された教師なしbinnerであるLorBinを紹介する。LorBinは、シングルコピー遺伝子を用いた評価決定モデルを用いた2段階マルチスケール適応型DBSCANおよびBIRCHクラスタリングを採用し、MAG回収率を最大化する。LorBinは、口腔、腸管、海洋サンプルを含むシミュレートされたマイクロバイオームと実際のマイクロバイオームの両… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2026%2F01%2F05%2F131327" title="マルチスケール適応型クラスタリングと評価によるメタゲノムロングリードの効率的なビニングを行う LorBin - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20260105/20260105211115.png Hatena Blog https://hatena.blog 2026-01-05 13:13:27 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2026/01/05/131327 1.0 100%