kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2026 Science multiple structural alignment (MSTA) 高速なツール LDDT structural aligners structure viewer phylogenetic tree Inference phylogenetic tree viewer タンパク質構造は配列を超えて保存されているため、遠縁のタンパク質を解析するには多重構造アライメント（MSTA）が不可欠である。計算予測法によって利用可能なタンパク質構造のリポジトリは大幅に拡張され、高速で正確なMSTA法が求められている。本稿では、ペアワイズ構造アライナーFoldseekとTM-alignを活用した、数十万のタンパク質構造の多重アライメントを行う革新的なMSTA法FoldMasonを紹介する。この手法は、最先端のMSTA法と同等かそれ以上のアライメント品質を実現しながら、2桁もの高速化を実現する。フラビウイルス科の糖タンパク質を用いて、FoldMasonのMSTAが「トワイライ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2026%2F01%2F30%2F210016" title="複数のタンパク質構造から多重構造アライメント(MTSA)を超高速に行う FoldMason - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20260130/20260130205729.png Hatena Blog https://hatena.blog 2026-01-30 21:00:16 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2026/01/30/210016 1.0 100%