kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2025 Surprisal Analysis Bioinformatics Advances RNA seq time series dataset SurprisalAnalysisは、Surprisal分析を用いて生物学的プロセスの結果として発現上昇または発現低下する傾向のある遺伝子のパターンを抽出するWebベースのアプリケーションを備えたオープンソースのRパッケージである。Surprisal分析は、遺伝子発現値を熱力学的観点から捉え、エントロピー駆動型の制約と関連する遺伝子重みを特定することで、各遺伝子の発現をベースライン（最大エントロピー）成分と1つ以上の制約駆動型成分に分解する。これらの成分は、観測されたシステムダイナミクスの基盤となる協調的な発現上昇または発現低下を伴う、個別の生物学的モジュールまたはプロセスに対応している。Su… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2026%2F02%2F17%2F001013" title="SurprisalAnalysis - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20260118/20260118121748.png Hatena Blog https://hatena.blog 2026-02-17 00:10:13 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2026/02/17/001013 1.0 100%