kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 2026 Preprint multiple sequence alignment (MSA) 構造予測の対象はRNAへと拡大したが、現在、深層アラインメントの生成がボトルネックとなっている。本著者らは、配列を重複するダイマー（2塩基単位）として表現する、RNAおよびDNA向けの検索・アラインメントツールRiboseekを開発した。RiboseekはBLASTNやnhmmerよりも高い感度で相同性を検出でき、アラインメント生成速度はnhmmerやrMSAと比較してそれぞれ250倍、376倍高速である。構造を考慮した再アラインメントを行うことで、rMSAと同等の塩基対復元精度を実現しつつ、処理速​​度は29倍高速に保たれている。また、構造を持つと推定されるRNAについて、ウェブサーバーおよ… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2026%2F08%2F05%2F150029" title="リモートヌクレオチド配列を高速に検索して大規模MSAを構築する Riboseek - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20260805/20260805144858.png Hatena Blog https://hatena.blog 2026-08-05 15:00:29 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2026/08/05/150029 1.0 100%