kazumaxneo https://blog.hatena.ne.jp/kazumaxneo/ macでインフォマティクス https://kazumaxneo.hatenablog.com/ 高速なツール 2026 Preprint AlphaFold Protein Interface protein-protein interaction (PPI) タンパク質間相互作用は、細胞内のきわめて多様な機能を媒介しており、そのため結合様式も多岐にわたる。近年、タンパク質構造の全体像を網羅的に把握し分類しようとする大規模な取り組みが進んでいる一方で、相互作用界面の構造多様性をインタラクトーム規模で評価し、クラスタリングするための同等の手法はこれまで存在しなかった。本研究では、三次元の相互作用界面構造を検索可能な配列へと変換することで、タンパク質相互作用界面の高速なアラインメントとクラスタリングを可能にする手法、Foldseek-Interfaceを開発した。本手法は、最先端の既存ツールと同等の精度を示しながら、最大230倍高速に動作する。Folds… 190 <iframe src="https://hatenablog-parts.com/embed?url=https%3A%2F%2Fkazumaxneo.hatenablog.com%2Fentry%2F2026%2F09%2F01%2F073234" title="タンパク質間相互作用の界面を検索・分類する Foldseek-Interface - macでインフォマティクス" class="embed-card embed-blogcard" scrolling="no" frameborder="0" style="display: block; width: 100%; height: 190px; max-width: 500px; margin: 10px 0px;"></iframe> https://cdn-ak.f.st-hatena.com/images/fotolife/k/kazumaxneo/20260901/20260901070904.png Hatena Blog https://hatena.blog 2026-09-01 07:32:34 rich https://kazumaxneo.hatenablog.com/entry/2026/09/01/073234 1.0 100%